dc.contributor.author | Fagerlund, Annette | |
dc.contributor.author | Langsrud, Solveig | |
dc.contributor.author | Moen, Birgitte | |
dc.date.accessioned | 2024-07-04T07:41:14Z | |
dc.date.available | 2024-07-04T07:41:14Z | |
dc.date.created | 2024-06-24T09:23:39Z | |
dc.date.issued | 2024 | |
dc.identifier.isbn | 978-82-8296-790-7 | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/11250/3137950 | |
dc.description.abstract | Sporing av Listeria monocytogenes er en viktig del av lakseprodusenters kvalitetskontroll. Det er økende interesse i laksenæringen for metoder som kan gi mer informasjon enn bare et svar på om listeria er til stede i en prøve eller ikke – altså genotypingsmetoder. Denne rapporten gir en grunnleggende oversikt over prinsippene bak eksisterende genotypingsmetoder, inkludert PCR-basert typing, MLST, MLVA og PFGE. Rapporten gir også en evaluering av metodenes oppløselighet når det gjelder å skille mellom relevante genetiske grupper av listeria, som er kjent gjennom analyser av helgenomsekvenseringdata. En viktig del av rapporten er en evaluering av den nye GENE-UP Typer metoden fra bioMérieux, utført som en digital analyse av et datasett bestående av over 1200 norske listeria-isolater. Resultatene viste at GENE-UP Typer metoden hadde noen fordeler sammenlignet med de klassiske genotypingsmetodene, inkludert et lavt nivå av feilklassifiseringer, men ikke høyere oppløselighet enn andre metoder. Genotyping kan være et nyttig verktøy i kvalitetsarbeidet, men kan ikke erstatte helgenomsekvensering for å spore smitte i næringsmiddelkjeden eller i produksjonsmiljøet i bedrifter. | |
dc.language.iso | mis | |
dc.publisher | Nofima AS | |
dc.relation.ispartof | Nofima rapportserie | |
dc.relation.ispartofseries | Nofima rapportserie | |
dc.title | Metoder for påvisning av Listeria i mat og produksjonsmiljø – Delrapport 3: Genotypingsmetoder | |
dc.title.alternative | Metoder for påvisning av Listeria i mat og produksjonsmiljø – Delrapport 3: Genotypingsmetoder | |
dc.type | Research report | |
dc.description.version | publishedVersion | |
dc.source.pagenumber | 17 | |
dc.source.issue | 19/2024 | |
dc.identifier.cristin | 2278218 | |
dc.relation.project | Fiskeri- og havbruksnæringens forskningsfinansiering: 901822 | |
dc.relation.project | Nofima AS: 13991 | |
cristin.ispublished | true | |
cristin.fulltext | original | |